bot_sequencias_genBank

Um bot em python que faz o download de sequências em XML de alguns arbovírus (dengue todos os tipos, chikungunya e zika) retiradas do banco de dados Genbank, usando o Chrome como navegador padrão

Sobre o navegador

Para usuários de Linux sem o Chrome instalado, acessem aqui um simples tutorial

Criação de um ambiente virtual

• Dentro da pasta do projeto, rodar no terminal:

   python3 -m venv "nome do ambiente virtual"
  

• Para ativar o ambiente virtual:

  • Linux:

       source "nome do ambiente virtual"/bin/activate
    

  • Windows:

       "nome do ambiente virtual"\Scripts\activate.bat
    

Instalando as bibliotecas

Dentro da pasta do projeto, rodar no terminal:

 pip install -r requirements.txt

No caso de problemas com diretório

No caso de problemas com o diretório de destino do arquivo com as sequências virais baixadas, algumas alternativas são:

• Desinstalar o webdriver-manager:

   `pip unistall webdriver-manager`
  

• Limpar o cache criado pela biblioteca:

  • Linux:

       rm -rf ~/.wdm
    

  • Windows:

       rd /s /q C:\Users\"SeuUsuario"\.wdm
    

• Reinstalar o webdriver-manager:

   `pip install webdriver-manager`